在1800年代以前，透鏡制造家一直不能夠制造不將光線分為組成色彩的透鏡。這個(gè)叫做色彩錯(cuò)亂或色線收差(chromatic aberration)的現(xiàn)象，總是造成有色的模糊物像。如果將某種色彩置于焦點(diǎn)，其他色彩就不清楚。

西元十七世紀(jì)，荷蘭人魯文霍克苜先利用顯微鏡發(fā)現(xiàn)細(xì)菌，從此人們才了解，釵h疾病是由這些微生物所引發(fā)。他用的顯微鏡??很原始，由一片透鏡來放大觀察。

一位名叫"Chester More Hall"的英國代書，早在1700年代就為望遠(yuǎn)鏡做出了矯正的透鏡，直到1830年代才做出來一種經(jīng)過度矯正的顯微鏡透鏡叫做"消差透鏡"。

1886年，在德國吉納跟卡爾.蔡斯(Carl Zeiss)一起工作的恩斯特.艾比(Ernst Abbe)，做出了名為"高度消差透鏡"，矯正了色彩和球面的像差的缺點(diǎn)。

1800年代末期，顯微鏡就開始了現(xiàn)代顯微鏡的樣子了。

1893年"August Kohler"提出了他所設(shè)計(jì)的照明裝置，到現(xiàn)今仍被采用。

1930年電子顯微鏡發(fā)明了。它不用透鏡折光來放大，而用電子來掃瞄觀察物，再將放大的特像呈現(xiàn)在螢光幕上。由于放大倍率高達(dá)二百萬倍，能精確的顯現(xiàn)物體最纖細(xì)的局部，因此連最小的病原體---濾過性病毒也逃不過。

1935年"Frita Zernike"發(fā)明了相位對(duì)比技術(shù)，使得原來無法用顯微鏡看清的標(biāo)本變得可以看清楚了。