電子游戲玩家或可通過(guò)游戲推進(jìn)癌癥研究
GENIGMA 游戲徽標(biāo) 來(lái)源:CRG/CNAG-CRG
CRG 和 CNAG-CRG 發(fā)起了公民科學(xué)倡議#GenigmaChallenge。
CRG 和 CNAG-CRG 今天推出了 GENIGMA,這是一款電子游戲,可以讓玩家解決難題,同時(shí)生成真實(shí)世界的科學(xué)數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)可以檢測(cè)基因組序列的變化并最終推進(jìn)乳腺癌研究。
該游戲今天在iOS和Android上推出,并提供英語(yǔ)、西班牙語(yǔ)、加泰羅尼亞語(yǔ)和意大利語(yǔ)版本,是基因組中心的一組研究人員開(kāi)發(fā)的為期兩年半的公民科學(xué)項(xiàng)目的結(jié)果監(jiān)管 (CRG)、Centro Nacional de Análisis Genómico (CNAG-CRG) 和游戲?qū)I(yè)人士。
該游戲旨在促進(jìn)依賴癌細(xì)胞系的全球研究工作,癌細(xì)胞系是科學(xué)家用來(lái)研究癌癥和測(cè)試治療該疾病的新藥的關(guān)鍵資源。癌細(xì)胞系的局限性之一是缺乏高分辨率的基因組參考圖,這對(duì)于幫助研究人員解釋他們的科學(xué)結(jié)果是必要的,例如精確定位具有治療意義的基因或潛在突變位點(diǎn)的位置。
“細(xì)胞系負(fù)責(zé)發(fā)現(xiàn)疫苗、癌癥化學(xué)療法或不孕癥的體外受精。這使它們成為現(xiàn)代生物學(xué)的支柱,”ICREA 研究教授 Marc A. Marti-Renom 解釋說(shuō),他同時(shí)隸屬于CRG和CNAG-CRG,其研究支持 GENIGMA?!叭欢?,缺乏基因組參考圖限制了當(dāng)前的科學(xué)進(jìn)步。這就像要求人們使用過(guò)去的地圖在現(xiàn)代城市中導(dǎo)航一樣。在其他人的幫助下,我們可以更新這些地圖,這將使我們?cè)谌橄侔?a href="/products/microscope/0-0-0-0-2129" title="研究" target="_blank" >研究方面取得快速進(jìn)展。”
Marti-Renom 教授的研究小組開(kāi)發(fā)了通過(guò)在 3D 空間中可視化基因組來(lái)創(chuàng)建基因組參考圖的方法。然而,這需要大量的時(shí)間和資源來(lái)訓(xùn)練人工智能,以及巨大的計(jì)算能力。
研究人員之所以推出 GENIGMA,是因?yàn)樗麄冋J(rèn)為與單獨(dú)使用 AI 相比,玩家生成的數(shù)據(jù)可能是更新參考地圖的更有效方法。玩家的“群體智能”還可以以人工智能可能無(wú)法提供的方式提供創(chuàng)造性的解決方案。
要玩 GENIGMA,玩家必須解決一個(gè)涉及一串不同顏色和形狀的塊的謎題。每個(gè)字符串代表癌細(xì)胞系中的一個(gè)基因序列,玩家如何組織塊是基因定位的潛在解決方案。
玩家必須重新組織積木,以便獲得盡可能高的分?jǐn)?shù)。玩家數(shù)量和得分越高,研究人員在參考地圖中找到該特定位置的正確順序的可能性就越高。
CRG 公民科學(xué)促進(jìn)者 Elisabetta Broglio 說(shuō):“世界上任何地方擁有智能手機(jī)的任何人都可以免費(fèi)下載 GENIGMA 并為研究做出直接貢獻(xiàn),將他們的邏輯和敏捷性用于科學(xué)服務(wù)。”?“GENIGMA 將作為一個(gè)集體而不是作為個(gè)人來(lái)分析玩家提供的解決方案,并將利用確定性算法無(wú)法找到的創(chuàng)造性解決方案?!?/p>
GENIGMA 在智能手機(jī)上的游戲畫面 來(lái)源:CRG/CNAG-CRG
研究人員將嘗試解決的第一個(gè)基因組參考圖譜是針對(duì) T-47D 乳腺癌細(xì)胞系,這是癌癥研究中最常用的資源之一。GENIGMA 的研究團(tuán)隊(duì)估計(jì),平均每人解決 50 場(chǎng)比賽的 3 萬(wàn)名玩家將產(chǎn)生足夠的數(shù)據(jù)來(lái)揭示該乳腺癌細(xì)胞系中 20.000 個(gè)基因的參考圖譜。
該游戲于 2022 年 1 月 27 日推出,開(kāi)展了為期三個(gè)月的活動(dòng)——?#GenigmaChallenge。每周一,為期三個(gè)月,GENIGMA團(tuán)隊(duì)將引入來(lái)自T-47D細(xì)胞系的新基因組片段,由玩家安排。第一個(gè)需要排列的基因組片段來(lái)自 17 號(hào)染色體,其中包含大量的乳腺癌相關(guān)基因。這包括 BRCA1,其突變與約 40% 的遺傳性乳腺癌有關(guān)。
GENIGMA 的開(kāi)發(fā)歷時(shí)兩年半,涉及 13 個(gè)研討會(huì)的 500 多人。該游戲由來(lái)自不同背景的不同群體構(gòu)思和測(cè)試,包括研究人員、學(xué)生、教師、藝術(shù)家、醫(yī)學(xué)專業(yè)人士、生物倫理學(xué)家、記者、來(lái)自患者組織的代表、藝術(shù)家和游戲開(kāi)發(fā)商。
JOCS al SEGON 的創(chuàng)意人員兼 GENIGMA 游戲設(shè)計(jì)團(tuán)隊(duì)的協(xié)調(diào)員 Oriol Ripoll 表示:“對(duì)于大多數(shù)人來(lái)說(shuō),科學(xué)常常感到難以接近,這就是為什么能夠拿起手機(jī)玩 GENIGMA 如此令人興奮的原因。您不僅可以結(jié)合電子游戲的普遍吸引力和流行度為推進(jìn)醫(yī)學(xué)研究做出貢獻(xiàn),您還將了解更多關(guān)于科學(xué)的知識(shí)?!?/p>
GENIGMA 由 ORION 資助,這是一個(gè)為期 4 年的項(xiàng)目,該項(xiàng)目已根據(jù)第 741527 號(hào)贈(zèng)款協(xié)議獲得了歐盟 Horizo??n 2020 研究和創(chuàng)新計(jì)劃的資助。該項(xiàng)目解決了 Horizo??n 2020 在科學(xué)下對(duì)“SwafS-04-2016”的呼吁和社會(huì)工作計(jì)劃。GENIGMA 也是與“Fondazione ANT Italia Onlus”和 Arima Genomics 合作的結(jié)果。
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